Pesan Populer

Pilihan Editor - 2019

Pemetaan molekuler menjadi mudah

Anonim

Setiap hari, setiap inci kulit di tubuh Anda bersentuhan dengan ribuan molekul - dari makanan, kosmetik, keringat, mikroba yang memanggil kulit Anda ke rumah. Sekarang para peneliti dapat membuat peta 3D interaktif yang menunjukkan di mana setiap molekul tetap hidup di tubuh Anda, berkat metode baru yang dikembangkan oleh peneliti University of California San Diego dan European Molecular Biology Laboratory (EMBL). Teknik ini diterbitkan 21 Desember di Nature Protocols .

iklan


Tujuan dari pemetaan 3D ini adalah untuk lebih memahami bagaimana molekul dari lingkungan kita, juga yang dihasilkan oleh tubuh kita dan komunitas mikroba pada kulit kita, mempengaruhi satu sama lain dan kesehatan kita. Ketika tim sebelumnya menggunakan pendekatan ini untuk memetakan molekul pada kulit dua relawan, mereka menemukan jejak tabir surya dan produk kebersihan lainnya, bahkan tiga hari setelah mereka terakhir kali digunakan.

Metode pemetaan molekuler 3D adalah gagasan Pieter Dorrestein, PhD, profesor di UC San Diego School of Medicine dan Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, Theodore Alexandrov, PhD, pemimpin tim di EMBL di Jerman, dan tim mereka. Mereka menentukan cara terbaik untuk mengumpulkan sampel, menentukan komposisi kimianya menggunakan spektrometri massa, dan membangun perangkat lunak pemetaan yang digunakan untuk analisis.

Setelah mereka didekati oleh banyak rekan dari bidang beragam seperti forensik, kosmetik, ekologi dan pertanian, para peneliti mengubah metode pemetaan molekuler 3D menjadi resep langkah demi langkah dengan perangkat lunak intuitif dan membuatnya tersedia bagi komunitas ilmiah global.

Rekan penulis studi ini meliputi: Ivan Protsyuk (penulis pendamping), Luca Rappez, Prasad Phapale, Sergey Ryazanov, EMBL; Alexey V. Melnik (penulis co-pertama), Louis-Felix Nothias (co-penulis pertama), Alexander A. Aksenov, Amina Bouslimani, UC San Diego.

Penelitian ini didanai, sebagian, oleh National Institutes of Health (5P41GM103484-07, GMS10RR02912101), National Institute of Justice (2015-DN-BX-K047), Program Penelitian dan Inovasi Horizon 2020 Uni Eropa, Marie Skłodowska-Curie Action dan 3D-Plant2Cells.

iklan



Sumber Cerita:

Materi yang disediakan oleh University of California - San Diego . Asli ditulis oleh Heather Buschman, Ph.D .. Catatan: Konten dapat diedit untuk gaya dan panjang.


Referensi Jurnal :

  1. Ivan Protsyuk, Alexey V Melnik, Louis-Felix Nothias, Luca Rappez, Prasad Phapale, Alexander A Aksenov, Amina Bouslimani, Sergey Ryazanov, Pieter C Dorrestein, Theodore Alexandrov. Kartografi molekuler 3D menggunakan LC – MS yang difasilitasi oleh Optimus dan 'ili software . Protokol Alam, 2017; 13 (1): 134 DOI: 10.1038 / nprot.2017.122